Automatisiertes maschinelles Lernen für die ZellkulturanalyseIntuitive Auswertung von Mikroskopiebildern
Der Einsatz von Mikroskopen in Laboren zur Analyse von beispielsweise Zellkulturen und Gewebeschnitten ist gängige Praxis. Biologische Experten werten dabei Bilder aus, um Rückschlüsse auf die zu untersuchende Probe zu erhalten.
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Bild 2: Dargestellt ist eine Zellkultur mit induziert pluripotenten Stammzellen (IPSC). Neben der besiedelten Fläche sind einzelne Kolonien für die Anlagensteuerung der StemCellFactory interessant. Dazu werden mehrere Zellklassen durch die generierte DL-Pipeline bestimmt und deren prozentuale Flächenanteile berechnet. Gleichzeitig werden die Kolonien nummeriert und morphologisch durch Größe, Umfang und Rundheit charakterisiert. Dies ermöglicht eine Weiterverarbeitung auch auf Kolonieebene, beispielsweise zum Picken. © Fraunhofer IPT