Automatisiertes maschinelles Lernen für die ZellkulturanalyseIntuitive Auswertung von Mikroskopiebildern
Der Einsatz von Mikroskopen in Laboren zur Analyse von beispielsweise Zellkulturen und Gewebeschnitten ist gängige Praxis. Biologische Experten werten dabei Bilder aus, um Rückschlüsse auf die zu untersuchende Probe zu erhalten.
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Die Algorithmen werden anwendungsfallspezifisch und automatisch ausgewählt und konfiguriert; der Anwender erhält dann das trainierte AIxCell-Modell. Damit kann er dann Mikroskopiebilder biologischer Proben mit Hilfe von maschinellem Lernen zu analysieren: Dabei lädt der biologische Experte Bilder in eine Weboberfläche (1) und annotiert bzw. bewertet diese initial. Alle nachfolgenden Schritte erfolgen voll automatisch. AIxCell wählt anhand der zur Verfügung stehenden Information die beste Pipeline aus (2). Eine allgemeine DL-Bibliothek (DL=Deep Learning) führt diese Pipeline aus (3) und stellt dem Nutzer die Ergebnisse im User-Interface zur Verfügung. © Fraunhofer IPT