ProteinquantifizierungVariable Fenster für die Quantifizierung
Die SWATH ® -Akquisition vereinigt die Qualität der Quantifizierung von zielgerichteten Analysen mit dem hohen Maß an Multiplexing der datenabhängigen Akquisitionsmethode (DDA).
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Bild 5: Zuwachs an quantifizierten Proteinen unter Anwendung vier verschiedener DIA-Methoden. Auf Protein-Ebene wurden mit über 3500 quantifizierten Proteinen signifikante Zuwächse verzeichnet, wenn die Anzahl der Fenster erhöht wird (bei verkleinerter Q1-Fenster-Größe). Die Geschwindigkeit der hochauflösenden MS/MS-Akquisition ist dabei ein entscheidender instrumenteller Faktor für die Durchführung von DIA mit einer hohen Fensteranzahl.