ProteinquantifizierungVariable Fenster für die Quantifizierung
Die SWATH ® -Akquisition vereinigt die Qualität der Quantifizierung von zielgerichteten Analysen mit dem hohen Maß an Multiplexing der datenabhängigen Akquisitionsmethode (DDA).
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Tabelle 1: Relevante Parameter der SWATH®-Methoden. Vier verschiedene SWATH®-Akquisitionsmethoden wurden für die Analyse eines Zelllysats verwendet, um den Einfluss der verschiedenen Methoden auf die Quantifizierung zu ermitteln. Der LC-Gradient, Instrument und Probenmenge wurden dabei konstant gehalten. * Eine Methode mit 20 Fenstern mit je 20 Da Breite über einen engen Massenbereich wird gegenwärtig auf anderen DIA-Instrumenten verwendet und wurde hier zum Vergleich gezeigt. Es wurden 125 ms Akkumulationszeit eingestellt, um eine mit den anderen Methoden vergleichbare Zykluszeit zu erhalten.