ProteinquantifizierungVariable Fenster für die Quantifizierung
Die SWATH ® -Akquisition vereinigt die Qualität der Quantifizierung von zielgerichteten Analysen mit dem hohen Maß an Multiplexing der datenabhängigen Akquisitionsmethode (DDA).
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Bild 2: Verkleinerung des Q1-Isoliationsfensters bei SWATH®-Akquisition verbessert die Spezifität. In diesem Beispiel wurde die gleiche Probe wiederholt auf einem TripleTOF®-6600-System analysiert – einmal mittels einer SWATH®-Akquisition mit fester 25-Da-Fensterbreite (links, 75 ms Akkumulationszeit) und ein weiteres Mal mit einer SWATH®-Akquisitionsmethode mit variabler Fenstergröße und 100 Fenstern (rechts, 25 ms Akkumulationszeit). Das Signal-Rausch-Verhältnis der Signalgruppe des detektierten Peptids ist, dank der viel kleineren Q1-Fenstergröße der variablen-Fenster-Methode, deutlich verbessert.