Automatisierte Präparationsmethoden

Automatisierte Präparationsmethoden

Die auf der epMotion-Plattform von Eppendorf automatisierten Methoden eignen sich auch für Illuminas TruSeq Stranded mRNA Library Preparation Kit für Next-Generation Sequencing. "Illumina-qualifiziert" bedeutet, dass Illuminas Analyse von Bibliotheken, welche mit Hilfe von epMotion-Methoden erstellt wurden, zeigte, dass die Leistung dieser Bibliotheken mit der Leistung manuell erstellter Bibliotheken vergleichbar waren.

Illuminas TruSeq Stranded mRNA Library Preparation Kit

Eine Vielzahl von Proben-Präparationskits steht für Next Generation Sequencing-Systeme zur Verfügung. Diese Kits werden benötigt, um entweder DNA- oder RNA-Proben in sequenzierfähige Bibliotheken umzuwandeln; ein Vorgang, der zahlreiche Schritte enthält und daher zeitaufwändig sein kann.

Die Sequenzierung von RNA beinhaltet zusätzliche Schritte - entweder die Entfernung ungewollter ribosomaler RNA oder die positive Selektion von mRNA aus Gesamt-RNA-Proben. Aufgrund der Komplexität der Methoden zur Bibliothekskonstruktion wird die Automation als sehr hilfreich empfunden.

Die epMotion-Methode kann zur automatisierten Konstruktion von 8, 16 oder 24 Bibliotheken eingesetzt werden, mit einem Ausgangsmaterial von 100...1000 ng Gesamt-RNA, gemeinsam mit Illuminas TruSeq Stranded mRNA Kit. Die aktive Arbeitszeit beläuft sich auf weniger als 1,5 Stunden, während die Gesamtlaufzeit für den kompletten Vorgang etwa 11,5 Stunden beträgt.

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Minimierte aktive Arbeitszeit und hohe Reproduzierbarkeit mit dieser automatisierten Methode tragen dazu bei, den Vorgang des Sequenzierens zu vereinfachen und zu standardisieren.

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