Fachbeitrag
DNA-Sequenziergeräte
Applied Biosystems
Applied Biosystems ist bekannt für seine Technologien, die die historische Entschlüsselung des Humangenoms ermöglicht haben. Mit SOLiD, dem Sequenziersystem der nächsten Generation, bietet das Unternehmen nun eine weitere Innovation für den Life-Science-Bereich. SOLiD vereint ultrahohen Durchsatz, Genauigkeit, Flexibilität und Skalierbarkeit.
Mit seinen Kapillarelektrophoresegeräten setzte Applied Biosystems Standards für die genetische Analyse – die Sequenziersysteme sind die robustesten weltweit. Bis heute haben 14000 Genetic Analyzer von Applied Biosystems weltweit rund 450 Genome entschlüsselt, 700 weitere Projekte sind in Arbeit.
Durch sein Angebot an Next-Generation-Systemen sowie der Entwicklung neuer Anwendungen für die Kapillarelektrophorese bietet Applied Biosystems Komplettlösungen für verschiedene Anwendungen von der Identifizierung über die Validierung bis hin zum Hochdurchsatz-Screening. Zusammen liefern die Systeme das breiteste Angebot für die genetische Analyse.
Beckman Coulter
- Eine Plattform für Sequenzierung, Fragmentanalyse und Genexpression (GeXP).
• Integriertes Hochdurchsatz-Gen-Expressions-Modul für schnelle und kostengünstige quantitative Genexpression (GeXP).
• Sehr langlebige und stromsparende Diodenlaser.
• Sehr einfache Handhabung.
ROCHE
Das Genome Sequencer-FLX-System bietet von der Probenvorbereitung bis hin zur Datenerfassung eine Gesamtlösung. Die Technik basiert auf einer neuartigen Nanotechnologie und generiert mindestens 100 Mio. qualitätsgefilterte Basen in einem 7,5-stündigen Lauf (Mitte 2008: 1 Mrd. in weniger als 24 h). Die 100 Mio. Basen bestehen aus mindestens 400000 Sequenzen mit einer durchschnittlichen Länge von 200...300 Basen (>400 Basen Mitte 2008). Bei einer 10...15-fachen Abdeckung beträgt die Konsensus-Genauigkeit mindestens 99,99 %.
Das System schließt sämtliche Softwarekomponenten ein, die zur Durchführung des Sequenzierlaufs, zur Datenakquise, zur Prozessierung der Rohdaten und zur Erstellung der Ergebnisdateien im FASTA-Format und von vom „National Center for Biotechnology Information“ (NCBI) akzeptierten Trace-Dateien notwendig sind.
Die Sequenzierungsreaktion erfolgt in sogenannten „PicoTiter-Plates“. Jeder Napf wird mit je einem klonalen DNA-Fragment, gebunden auf einem Trägerbead, beschickt. Zusätzliche Auftragshilfen erlauben die parallele Sequenzierung von bis zu 16 unterschiedlichen Proben und bieten damit höchste Flexibilität.
Als einziges Hochdurchsatz-System ermöglicht der Genome Sequencer FLX die Verwendung unterschiedlicher Adaptoren (12 Stk.) für die spezifische Erkennung mehrerer Proben in einem Lauf an (Multiplex Identifier/MIDs).
Diese Antwort stammt von Jürgen Boelter und Volker Strack, Key Account Manager Sequenzierung.
Das könnte Sie auch interessieren
Wie Bakteriophagen die bakterielle Zellwand angreifen
Eine Untersuchung an DESYs Röntgenring PETRA III zeigt, wie spezielle Viren den lebensbedrohlichen Durchfallkeim Clostridium difficile abtöten. Die Studie von Forschern der Hamburger Niederlassung des EMBL enthüllt, wie bestimmte Enzyme dieser Viren...
mehr...In der BioRegion Nord gehen Groß und Klein zusammen
Lebensart und Wissenschaft gehen Hand in Hand im Life Science-Cluster Nord, sagt Dr. Karin Adlkofer von der Life Science-Agentur Norgenta. Sie fungiert als Anlaufstelle für alle, die sich nördlich der Elbe im Gebiet zwischen Nord- und Ostsee mit...
mehr...BioRegionen in Nordrhein-Westfalen
In insgesamt 16 Felder ist die Clusterpolitik im bevölkerungsreichsten Bundesland Nordrhein-Westfalen aufgeteilt. Hier bildeten sich seit den 1990er Jahren fünf große Bio-Regionen unter Schirmherrschaft der BIO.NRW heraus: Bioriver – Live...
mehr...Effizienz und Leistung
Die neue Pioneer mit vielen Funktionen zum intelligenten Betrieb in Ihrem Labor. Mit antistatischem Stab zur Erdung. Weitere Informationen über die Waagen Pioneer PX
mehr...Stabilität der Quartärstruktur eines Proteins
Zum Verständnis der Aktivität und Regulation von Enzymen kann die Kenntnis ihrer Quartärstruktur eine Menge beitragen. Vor allem bei Enzymkomplexen, die aus mehreren Untereinheiten bestehen, findet man in Bezug auf ihre Aktivität deutliche...
mehr...BioRegion STERN
Mit der 1999 neu gegründeten BioRegion STERN strahlt der Großraum Stuttgart mit Tübingen, Esslingen, Reutlingen sowie dem Neckar-Alb-Kreis weit über die Landesgrenzen von Baden-Württemberg hinaus. Hier überwiegen die biomedizinischen und...
mehr...BioRegion Martinsried
Auf der BIO-Europe in München wurde am 14.11.2008 offiziell von Bayerns Staatsregierung mitgeteilt, dass München mit Martinsried eindeutig den Schwerpunkt der schnell wachsenden Biotech-Landschaft in Deutschland darstelle. Über 130 Biotech-Firmen...
mehr...Highlight der Woche
Quadrupol-Massenspektrometer PrismaPro®
Mit dem PrismaPro bietet Pfeiffer Vacuum ein Quadrupol-Massenspektrometer für die qualitative und quantitative Gasanalyse sowie zur Lecksuche an.
Zum Highlight der Woche...Highlight der Woche
Perfekte GCMS-Ergebnisse dank Shimadzu NX-Technologien
Shimadzu erweitert die Singlequad- und Triplequad-GCMS um den Gaschromatographen GC-2030. Damit werden Analysen präziser, Wartungsarbeiten vereinfacht und die Geräteauslastung maximiert.
Zum Highlight der Woche...Vorteile im Verbund
Die Bio-Europe Partnering 2008 in Mannheim vom 17. bis 19.11.2008 nutzten die Pharma-Branchenriesen Roche, Merck Serono und Abbott zur Mitteilung an die Fachwelt, dass sie im Rahmen des siegreichen Bio-Clusters Rhein-Neckar noch enger zusammen...
mehr...Knochenfunde geben Rätsel auf
Der Kyffhäuser birgt viele Geheimnisse. Bekannt ist das Mittelgebirge südlich des Harzes durch die Barbarossa-Sage. Doch der mit Höhlen durchzogene Berg gibt in noch ganz anderer Hinsicht Rätsel auf. Bei Ausgrabungen nahe dem Ort Bad Frankenhausen...
mehr...Biokalorimetrie in der Wirkstoffforschung
Eines der ersten internationalen Treffen von Wissenschaftlern zum Thema biokalorimetrische Anwendungen fand vor mehr als 10 Jahren im englischen Oxford statt. Seither erweiterte sich die Verwendung der Biokalorimetrie in den biologischen...
mehr...